一个单元的房子在房产证上被错误地登记成两个

房产证内容与登记不一样的以不动产登记簿为准，有证据证明不动产登记簿确有错误的除外。我国实行不动产统一登记制度，取得、变更房屋所有权以不动产登记为准，即房屋所有权以物权登记为准，通过不动产权属证书或者登记证明享有产权。
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房屋权属争议纠纷应当先提起民事诉讼，对权属争议房屋进行确权，若民事判决确认原告对争议房屋具有权属份额，再持该生效法律文书向房屋登记部门申请更正登记。
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办理房屋产权证的流程：1、初始登记2、填写申请表：申请表填写之后需要开发商签字盖章。3、拿会测图／表：由于测绘表是登记部门确定房产证上标注面积的重要依据，因此是必需的材料之一。4、领取相关证件：在前面询问相关部门时，一定要明确需要领取哪些必要的申请文件，一次齐全。5、缴纳公共维修金，契税：公共维修基金一般由房产所在地区的小区办收取，部分城市已经开始由银行代收公共维修基金，缴纳的方法可以询问开发商的办事人员。6、按照规定时间领取房产证：一定要保存好管理部门给的领取证书的通知书，并按照上面通知的时间领取房产证。